2007年进入广东深圳新胜威篮球俱乐部，跨出了篮球职业生涯的第一步。
2010年1月进入东莞新世纪三队，2010年7月全国U15冠军，10月秦皇岛U15冠军，11月担任三队队长。
2011年4月全国U16亚军，6月全国U16季军。
2012年2月U17冠军，3月青年联赛预赛冠军。9月全运会预赛亚军。10月决赛大比分赢得宏远，夺得全国青年联赛冠军。在此次全国青年联赛中，毕鹏飞场均十分左右，发挥稳定。
2013年全运会，毕鹏飞加入广东代表团获得全国第三名。
2014年3月青年联赛预赛亚军，6月俱乐部杯季军。
2014年7月入选南京青奥会三人篮球项目，在8月份青奥会的比赛中敢打敢拼、发挥稳定。在对战乌拉圭、匈牙利、印度尼西亚的比赛中场均拿下8分以上。
2014年10月，毕鹏飞加盟江苏同曦男篮一队。全新的球队，全新的联赛，欢迎他的加入！希望他在江苏同曦的篮球之路越走越好！
